馬總統上午在總統府秘書長楊進添、國家安全會議秘書長袁健生、國防部部長高華柱、參謀總長嚴明等人陪同下，先後前往國防醫學院預防醫學研究所、軍備局中山科學研究院系統製造中心、國軍桃園總醫院及陸軍航特部特種作戰指揮部等單位視導。
其中，預醫所是預防各種生物細菌戰爭的單位，而中科院系製中心則是國軍研發、設計與製造各式敏感飛彈的單位。
針對屏東琉球籍漁船「廣大興28號」遭菲律賓公務船開火攻擊事件，馬總統中午與特戰指揮部代表官兵餐敘時致詞表示，最近東海、南海都是多事之秋，政府在東海部分以和平方式解決跟日本40多年來的漁業爭議。
他指出，南海部分因菲國海巡部隊以機關槍、自動步槍掃射中華民國沒有武裝的漁船，造成1名漁民死亡，讓全國民眾感到非常激憤，政府以理性與務實態度要求菲國「道歉、緝凶、賠償並儘速啟動台菲漁業協議談判」。
總統強調，這些問題都在積極進行當中，也越來越接近最後階段，希望儘快把問題解決。一方面讓家屬能得到正義伸張，也讓中華民國跟菲國關係在解決上述問題後，回到過去狀態。
總統在會中也特別稱讚特戰官兵「訓練精良、高人一等」；他說，特戰部隊不論在救災、漢光演習、聯雲及聯勇操演或前2個月剛執行完畢的山隘行軍訓練等任務，表現都非常傑出。相關訓練的開創性作法，讓國軍做到「戰時打勝仗、平時可救災」。
他強調，不論戰爭型態怎麼改變，最基本的訓練一定要維持在水準以上，要永遠抱持敵情觀念，並帶著這項觀念練兵。
另外，總統說，政府改善與中國大陸的關係，不代表有任何鬆懈，還是要保持建軍備戰應有努力。國軍在過去60多年來光復、保衛、建設與守護台灣，有非常光榮的傳統，以及高素質官兵。