國台辦發言人范麗青還指出，兩會互設機構主要是為兩岸經濟文化交流及維護兩岸民眾權益提供服務，屬於「服務性質」；另關於兩岸政治協商，目前兩岸專家、學者有希望解決兩岸政治分歧問題的積極性，先就此類問題展開民間性研討，有助於增進相互了解，可為今後破解政治難題創造條件。
說一套做一套？ 蕭美琴要王郁琦說清楚
針對范麗青所謂兩會互設機構屬於服務性質，以及中方注意到台灣表達「兩會互設辦事機構『不是外交領事機構』」等談話，民進黨立委蕭美琴質疑，陸委會主委王郁琦應交代清楚，是否在立法院答詢說一套，聲稱對中爭取領務功能、人道探視權等，卻在實際談判上做一套？如今國台辦說法與陸委會說法有落差，令人擔心空白授權的危險性高。
民進黨立委陳其邁批評，若如中方所言，旅行簽證、人道探視權只是服務性質，反映中國將台灣視為特區或一省，馬政府若呼應配合，無異自降國格；國台辦的說法等於中國以宗主國的姿態，採港澳中聯辦模式對待台灣，使台灣陷入一中框架，台灣派去的只是駐京辦，被矮化，我方絕對不能接受。
陸委會則認為，從廣義面來看，兩岸過去所簽署的十八項協議，包含互設辦事機構議題中談到的核發旅行證件、人道探視，確實都涉及到所謂政治因素。但以狹義面來看，有關政治對話等談判，目前政府仍認為條件、時機不成熟，也還沒有足夠的共識。因此，兩岸當前還是應就有利各自發展、民生福祉議題進行協商。
前海基會秘書長邱進益昨在兩岸互設辦事處的相關座談會中表示，兩岸兩會互設辦事機構有助建立兩岸制度性溝通，辦事機構的代表就是實質上的政府代表，互設辦事機構建立長期制度性溝通管道，「代表就是信使」，傳達正確訊息，避免未來兩岸可能出現的誤判、誤讀。