至於教授假發票案部分，檢察總長黃世銘指示各地檢署針對個案持續蒐證，逐一釐清個案犯行是屬於「公款公用」或「公款私用」。並等最高法院針對公立大學教授兼辦採購業務，是否具有刑法之「授權公務員」身分確認後，再依法處理。
目前調查局台北市調查處仍然持續約談、移送涉案教授，台北地檢署已經將一百五十多名台大、政大、師大教授列為被告；另前陣子曾遭市調處約談的台大醫師柯文哲，則尚未移送北檢偵辦。
朝野立委都認同「歸零處理」
陳明堂表示，行政院提出覆議案後，原本通過條文自動失效，由於總統府不會依照原先計畫在十一日公布修正條文，因此修法也就不生效力，顏清標等人也就不能除罪、出監。
馬英九總統昨天親上火線道歉，並指示行政院提出覆議後，終於讓壓力沉重的立委找到下台階。國民黨團書記長賴士葆立即呼應府方立場，籲黨籍立委共同支持覆議案；民進黨團則公開為修法疏漏向人民道歉，同時也宣示讓法案「回到原點」的決心。
據了解，國科會主委朱敬一昨天拜會立委協商組織法時曾私下埋怨，《會計法》修法若翻案，教授恐將「血流成河」。立委則回應，教授核銷經費除罪化的法案還躺在委員會裡，只要財委會召委肯「不計毀譽」地排案審查，全案仍可能起死回生；但民代特別費除罪化部分，則幾乎不可能再有討論空間。
立法院下周一協商議事問題
由於草率修法鬧出爭議後，朝野立委對於何時再修《會計法》，態度顯得保留。有立委表示，事前根本沒人料到會計法修法能鬧出這麼大的風波，短期內不會有人想再碰這個馬蜂窩。不只基層民代除罪無望，就連教授除罪也非常不樂觀，「這條法案，大概就卡在這邊不會動了。」
得知政院將提覆議後，民進黨團總召柯建銘表示，立院復議與政院覆議間的競合關係，需由議事處解釋，但民進黨團原則同意「歸零處理」的解決方式。
賴士葆表示，國民黨團將於下周舉行黨團大會，爭取黨籍立委支持政院覆議，藉此讓日前三讀通過的《會計法》修正案失效。立法院長王金平也隨即邀集朝野黨團，於下周一上午協商後續議事問題。