馬總統在接受日本共同通信社專訪時表示，東亞情勢罕見，台日、日中和台灣與大陸之間都有爭議或緊張關係；總統表示，東海和平倡議先實踐「三組雙邊協商」，再考慮「一組三邊協商」，台、日可以就漁業達成協議，日本也可以與大陸就資源問題協商；同樣地，台灣與中國大陸也可以就漁業或其它問題進行協商。
總統表示，日本與中國大陸已經簽署漁業協議；台灣與日本簽訂了漁業協議、與大陸在台灣海峽也有石油方面的合作及海上救難的聯合演習；換言之，大家都有一些雙邊的基礎，如果從這個基礎出發，也許就能把釣魚台爭議範圍縮小。
總統表示，台灣與中國大陸共簽訂了18項協議，其中與海洋有關的主要是海運方面，在海洋其他資源的運用方面卻沒有任何協議，但台灣與大陸在海洋的運用方面有許多重疊之處，因此總統呼籲，雙方不是不能在養護(conservation)與管理(management)等領域進行合作，台灣不排除與中國大陸簽訂漁業協議，建立一個共同的養護與管理區域。
總統也表示，他可以理解為什麼大陸猶豫與台灣談漁業協議，因為擔心變成國與國的關係，但他在很多場合都說過，兩岸關係不是國與國的關係，而是一種特殊的關係。雙方簽署過的協議都不是在國與國的基礎上簽訂，但並不妨害簽署之後，協議在雙方所管轄的區域內發生效力。他並以台日漁業協議為例，表示是由雙方的「亞東關係協會」及「日本交流協會」簽署，簽了之後一樣有拘束力，也使過去40年存在的問題找到務實解決的方案。
總統強調，「東海和平倡議」不是只為兩方或一方設計，是為三方設計，他的用詞也很小心，沒有強調「三國」，而是「三方」，就是希望能解決問題，以務實的態度降低緊張關係，為三方人民帶來安定及和平，讓東海成為和平與合作之海。