依據疾病管制局監視資料顯示，腸病毒疫情於5月底至6月中達到最高峰，在上週超過兩萬人湧入門診，急診就診也有1800多人，比率創下六年來第二高。雲林縣今年至5/31止無重症個案，但學童因感染腸病毒有185人，教保育機構總共停課68班次（幼兒園22所55班、國小13所13班）。腸病毒71型較會併發腦幹腦炎、心臟衰竭、肺水腫與肺出血等重症，請提高警覺加強各項防治措施，防範群聚發生。
人類是腸病毒唯一的傳染來源，主要經由腸胃道（糞-口、水或食物污染）或呼吸道（飛沫、咳嗽或打噴嚏）傳染，亦可經由接觸病人皮膚水泡的液體而受到感染。在發病前數天，喉嚨部位與糞便就可發現病毒，此時即有傳染力，通常以發病後一週內傳染力最強；而患者可持續經由腸道釋出病毒，時間長達8到12週之久。本局提醒家長，應避免嬰幼兒與腸病毒病人接觸，教托育機構應加強宣導學童確實做好個人衛生，落實正確勤洗手及「生病不上學」的觀念，並定期進行環境清潔及重點消毒，同時配合落實執行疫情通報及停課機制，而生病請假或停課的學幼童，應在家好好休息，不要到補習班、安親班或其他擁擠的公共場所活動，以降低感染與傳播的機會。
腸病毒重症病程發展快速，只有短短數小時之黃金治療時間，若家中嬰幼兒經醫師診斷感染腸病毒時，應設法與其他幼兒隔離，減少接觸，以降低交叉感染的機會，並注意觀察是否出現「嗜睡、意識不清、活力不佳、手腳無力」、「肌抽躍（無故驚嚇或突然間全身肌肉收縮）」、「持續嘔吐」與「呼吸急促或心跳加快」等重症前兆病徵，一旦出現上述任一病徵，請務必立即送至大醫院接受適當治療，掌握治療的黃金時間，以免貽誤病情。