總統馬英九3日表示，有關兩岸政治協商早就已經展開，他認為目前海基會、海協會所商討的互設辦事機構議題，就是政治協商的開端，他也反問大家，辦事機構裡頭許多討論重點，包括探視權、掛國旗、放國號、核發旅行證件等，哪一項不是所謂的政治協商？
馬英九昨日南下墾丁進行能源之旅，在與媒體主管茶敘時，他語出驚人表示，九二共識就是政治，司法互助協議也是政治，內中有互不否認治權、互相承認管轄權的意義，當然是政治。
他直言，目前兩會所談的互設辦事機構議題，廣義來說，政治協商早已展開。同時也強調，會在一中各表，也就是「一中就是中華民國」架構下與對岸展開談判。
馬英九的談話，也引發在野黨立委質疑，民進黨立委陳其邁就認為，辦事機構我方想要的都拿不到，只是不斷自我設限、矮化，未來進而開展到和平協議、軍事談判，台灣主權就這樣一點點的被賣掉。
大陸國家主席習近平日前拋出對台「法令解套」、「軍事談判」及「政治談判」三項作法，立委林世嘉直言，馬政府就是配合演出，對政院版本兩岸辦事機構草案，未來她一定反對到底。
目前兩會辦事機構草案，正在立法院進行審議，由於在野黨不滿馬政府只審查政院版本草案，利用杯葛方式來癱瘓議事。最後藍綠雙方妥協，將加開臨時會併民進黨、台聯草案一起審查，但當天擔任召委，必需是國民黨籍的江啟臣。
由於綠營所提的版本，裡頭包含納入維也納公約、掛國旗等具體要求，屆時雙方勢必會有新的一波攻防。