立法院院會上會期最後一次院會「突襲」通過「會計法部分條文修正案」，被外界批評是替前立委顏清標和台大醫師柯文哲量身修法。民進黨立委趙天麟更砲轟黨團幹部事先未告知，就要黨團成員集體背書。不過，趙天麟的態度3日轉趨低調，不再對外發言。
對於會計法的修法爭議，民進黨立委黃偉哲認為，不論是民代還是學者，都不應有特殊待遇。他並指出，黨團幹部在黨團大會時沒有討論這個法案，他也不知道朝野協商會討論會計法。他說：『(原音)如果問10個民進黨黨團成員，大概8、9都說不知道那天有通過這樣決策，不是大家很大開大闔討論，沒印象黨團針對這個事情做過清楚、清晰討論，可是結果卻是要黨團成員共同承擔，這點坦白講是有點傷。』
對此，民進黨團總召柯建銘表示，之前在立法院財政委員會已經討論過會計法修法，之前的黨團會議也有討論，當天因為有太多法案要處理，所以才沒有公開討論；柯建銘也表示，民進黨團是為了替教授報帳解套，才同意通過修法，「政治必須做抉擇，大家要一起承擔」。他說：『(原音)所以今天要講清楚，會計法修正有歷史淵源，民進黨為了解決教授問題，所有黨鞭，這些簽名的人難道是我一個、一個壓上去的嗎？我們是最後被告知要處理這個案的。』
柯建銘也喊冤，表示修法草案是國民黨立委提出，為何外界都責怪民進黨？他要求國民黨團、行政院和總統府說明。他並指出，既然特別費已經除罪化，下一步應該討論國務機要費除罪化問題。