日本政府地震調查委員會五月底提出一項地震預測值，指出從靜岡縣駿河灣到九州東方外海水深四千公尺的南海海溝，發生芮氏規模八到九強烈地震的機率是：「五十年內九十％」。同時，襲擊東京首都圈的規模七直下型地震發生機率，也是「五十年內九十％」。所謂的南海大地震一旦發生，帶來的強震和巨大海嘯，最壞情況可能造成約三十二萬人死亡、六十二萬人受傷、兩百三十九萬棟家屋全毀，以及兩百二十兆日圓的經濟損失。
地震調查委員會在二○○一年首次對外發佈地震發生機率，之後將日本可能發生的地震分為東海、東南海、南海等三地域，由於「千年只發生一次」的三一一大震在預測範圍外，因此調查委員會重新計算，最受矚目的是反覆發生規模八以上地震的南海海溝。這次公佈的數據是，此一海域發生規模八到九大地震的機率，十年內為二十％、三十年內為六十到七十％、四十年內為八十％、五十年內達九十％。
市街建築計畫研究所所長渡邊實指出，大地震來襲並非一百年或兩百年以後的事，而是「已迫在眼前」。政府地震調查委員會委員長本藏義守也強調，「有相當的緊迫性」。日本負責地震問題的「有識者會議」也指出，預測地震的發生，在現狀上仍有困難，因此「事前準備非常重要」。
細心對國民規定災害必備品
日本政府的地震報告書對民眾提示的「巨大地震時所需備品」明細表鉅細靡遺，令人嘆為觀止，其中建議每人應準備一週所需用品，例如「攜帶七支小型瓦斯筒，每支可煮沸一．五公升的水十次，用以保持體力」；其次是「攜帶電話充電器」；第三是準備七天二十一餐的食物以及其他乾糧；第四是每人每天最少需要三公升飲水，「至少應準備二十一公升」等，甚至還算出一個人每天上廁所約五到六次，七天就是約四十次，一次的「量」約兩百ＣＣ，因此建議「準備四十次分的簡易便器」。如此細心對國民規定災害時必備品的國家，可能只有日本。
日本官民地震專家咸信，大地震在可預期的將來發生機率高達九成，雖仍無法預知地震發生的具體時間，但只要事前做好準備，亦即所謂的「事前防災」，還是可以將損失降至最低，且對做好事前防災有相當自信。台灣和日本一樣也是地震大國，馬政府在這方面準備好了嗎？