台灣高鐵表示，地震時有6列車正在行駛，部分列車斷電，下午2時許恢復供電，以低速重新發車，就近到站後請旅客下車，並依安全程序巡軌，延遲超過3個小時，共計有27列車取消，5萬人次以上的旅客受到影響。
台灣鐵路管理局表示，地震共影響54列次計2萬多名旅客。二水到林內間有約200公尺鋼軌彎曲，列車改以慢速通行，下午4時許已恢復正常。
高速公路局指出，國道3號在地震時有幾處路段的中央分隔島防眩板掉落，國道6號33公里處的橋梁底部有水泥塊掉落至底下防汛道路，高公局已派員處理，目前無結構安全的問題。
公路總局說，南投發生地震後，立即成立緊急應變小組，經工務段巡查及積極搶修下，截至晚間為止，只剩下南投縣信義鄉台16線地利路段因落石而道路封閉、台21線塔塔加路段因持續落石，對路段做預警性封閉。