由前述關於扁的再入黨案申請過程，可知強悍的「一邊一國連線」讓黨中央與地方都有所忌憚，深怕稍有差池得罪了「阿扁們」，成為其攻擊的對象。「一邊一國連線」之所以令人害怕，不僅因為其支持者的情緒大多激昂，而是「一邊一國」的主張從來就是非常霸道無理。嚴格來說，「一邊一國」並不等於「台獨」，真正支持台獨理念的人至少懂得尊重住民自決，可以包容持不同意見和立場的人，但是「一邊一國」則否。
試問台灣和中國為何只能「一邊一國」？若主張台獨，認為世界各國應當尊重台灣住民自決前途的人，理應也會支持西藏、蒙古或東突的住民自決，同樣也該尊重蘭嶼、金門住民自決的權利，這樣一來，何止「一邊一國」？強制「一邊」只能有「一國」的主張，自始就必然充滿矛盾，而且這絕非文字遊戲，「一邊一國」正因為在邏輯上難以自圓其說，所以在實踐上就變成可以任意的選擇支持或反對的對象，不須要理由。因此，「一邊一國」的支持者可以贊成西藏、蒙古和東突的獨立，但是又對金門自中國大陸引水、興建金廈大橋充滿敵意，一方面想跟中國劃清界線，另一方面又不讓其他人與其劃清界線，應該更名為「這邊一國」還比較名符其實。
相較於統派與獨派，「一邊一國」可說是意識形態真空的主張，既不追求民族復興──擺脫列強操控而獨立；也不堅持住民自決前途的權利。「一邊一國」完全是工具性的，它的原創者陳水扁是為了挽救當時自己岌岌可危的政權，後繼者則是為了確保和分食阿扁所遺留的既得利益，在政治上集結成派。沒有意識形態的對手是最恐怖的，因為他為了達到目的可以不擇手段；為了保全自己的利益，可以和任何人結盟，也可以和任何人為敵，這是「一邊一國」最讓人感到可怕的地方。