調查團昨中午抵達屏檢，團員下車後立即上樓，並未停下來說明，僅由屏檢主任檢察官謝志明發言。他說明調查程序，先與調查團開協調會，整合問題再依我國刑事訴訟法，由我方檢察官以隔離約詢方式，詢問廣大興28號證人，再由菲方提出疑問。
另外，雙方並交換偵辦心證及證據，屏檢應菲方請求，提供船員筆錄、解剖報告及錄影光碟、航跡圖複製檔案、漁船勘驗鑑識報告、彈道比對鑑識報告等證物。
謝志明說，除了重新解剖船員洪石成遺體及驗屍之外，其它能夠提供的證物都會盡量提供，希望幫助菲國調查團追緝行凶者，還原事發真相。
他強調，菲律賓來台調查是件不容易的事情，只要菲方有任何疑問，我方會立刻提供解答，讓他們獲得足夠資訊。
依照台菲雙方商定的採證程序，雙方在互信的原則下，先進行傳訊證人，針對卷證資料交換意見，但是，雙方有簽署保密協定，無法公開詳細偵查內容。
下午兩點過後，洪育智與洪介上由洪家大姊洪慈綪陪同前往屏檢，先由洪育智在第七偵查庭接受詢問，之後換洪慈綪接受約詢。
晚上七點，謝志明舉行記者會說明，他說經四小時問訊，已完成洪船長與洪慈綪的司法互助部分，兩人在菲國調查團建議之下，有對菲國公務人員提出告訴程序。
約詢過程中，菲國調查團坐在法庭內，不讓他們坐在檢察官右手邊，都是讓律師、調查團人員配備電腦，也有螢幕讓他們閱讀筆錄，並透過翻譯人員翻譯，每次告一段落會徵詢調查團意見，看他們是否有問題，中途休息三次，主要就內容再次細問確定。
調查團預計廿九日上午九點，前往屏東東港鎮大東華修船廠，勘驗鑑識廣大興28號，等菲律賓調團勘驗結束後，將開放媒體登船拍攝漁船遭受槍擊情形。
下午兩點半調查團將前往台南成功大學勘驗漁船航跡圖，卅日上午在刑事警察局子彈鑑驗及勘驗彈道。
菲律賓調查團昨天搭乘高鐵於上午十一點六分抵達高鐵左營站時，左營警分局及高鐵警察均派出約廿名便衣警員在外圍安全維護，過程平和，未發生突發狀況。之後在馬尼拉經濟文化辦事處高雄分處代表引導下，隨即換搭三輛廂型車前往屏東。