國防部發布新聞稿指出，國軍與海巡署進行的聯合護漁任務，並非外界所謂「軍事演習」。
國防部表示，「國軍軍語辭典」明確定義，「軍事演習」乃在假設戰鬥狀況下，對戰術、戰技、勤務支援等原則運用與演練，目的在驗證作戰計畫與戰術原則的可行性；「操演」則是指結合訓練「人器合一」操作，或結合部隊編裝的測驗式操演。
國防部進一步表示，為宣示國軍捍衛國家主權，展現積極主動護漁決心，海軍5月15、16日以「主官率隊」結合空軍及海巡艦艇執行聯合護漁操演，期間實施海空聯合搜索與救難、人員落水，以及海軍、海巡艦艇指管通聯機制驗證等科目，操演已達成聯合護漁的目標。
國防部也說，中華民國是民主憲政國家，有關護漁工作及海域執法，都是由具執行司法權的海巡署負責處理，國軍對於護漁任務的立場是「凡我國漁船作業海域，即有海巡艦艇保護，有海巡艦艇之海域，即有海軍艦艇策護」。
國防部強調，維護國家主權、保障漁民海上作業安全為國軍職責，國防部將以具體的策護應援作為，當漁民和海巡署的堅強後盾。