外交部亞太司司長何登煌今(23)日表示，由於雙方提出的實質調查項目尚未達成共識，因此本周要互派調查團的可能性不高。不過，由於台灣是受害一方，我方仍極力爭取，希望我方調查人員能先行赴菲。
有媒體報導，菲律賓司法部門，預計本周五就會派調查團來台調查「廣大興28號」漁船案，但何登煌證實，這項消息並不正確，我方也尚未核發簽證。
他表示，目前雙方仍就彼此提出的實質調查項目做最後確認，我方一共提出10項要求、菲國則有11項，最後可能不會全部接受，但有些堅持的部份我方一定會爭取。
此外，由於台灣為受害一方，何登煌強調，我方還是希望調查團能先行，或是同時派出調查團，但最後該怎麼做，也有待雙方進行溝通。
外交部發言人高安則表示，在雙邊正式啟動司法互助程序後，有關司法調查的部分，就要由法務部做為單一發言窗口，外交部會在行政工作上給予協助。而在外交溝通上，雙邊會以駐菲代表處(TECO)與馬尼拉經濟文化辦事處(MECO)的架構下，就本案做後續的協商與談判。
此外，近來引起軒然大波的便當文，也讓菲籍人士在台安全引發關注，高安強調，外交部會持續讓在台菲籍人士，還有外籍人士感受到，台灣是一個安全和善的社會；另外也會不定期向國際，來說明我方立場與本案真相，截至目前為止已獲得許多迴響。