經濟部九十九年底投入一．三億元，進行「台灣本土天然藥物產業技術開發計畫」，其中三千萬用於研究牛樟芝產品研發及應用，「安全性」由昌達生技公司負責，「功效性」由經濟部生技中心、工研院研究。
昌達生技以大鼠動物實驗，連續九十一天口服野生牛樟芝子實體粉末，按體重每公斤給予兩百、六百、兩千毫克劑量，相當於人體每天口服十二、卅六、一二○公克。研究報告日前曝光，顯示服用後大鼠腎上腺開始腫大、母鼠卵巢重量也增加。
研究牛樟芝有成的前林務局長、大葉大學校長何偉真昨天質疑，此研究以「野生牛樟子實體」為材料，來源不明、成份有爭議。而過去十八年近百篇碩、博士論文，大鼠實驗沒有一篇是負面的；甚至同樣在此計畫中，生技中心、工研院評估牛樟芝「功效性」也證實對肝癌、肺癌有療效。
「片面的研究結果，不能一竿子打翻一船人。」她指出，一般人因經濟考量，每天僅約吃一克以內，此研究設計餵食劑量高估一般人每日食用量十倍至百倍，「任何保健食品都有安全劑量，甚至喝水過量也會中毒。」
全球第一位替牛樟芝命科學名的農委會林試所研究員張東柱表示，該計畫原計研究三年，主要目的是找出牛樟芝「無毒安全劑量」，但還未找到無毒劑量，計畫就在進行一年後喊卡，並非一個完整的研究結果。