民進黨立委段宜康21日指出，包括行政院政務委員薛琦等多位政府首長上任後仍忙於參與國科會研究案，並大賺國科會的研究經費。
對此，薛琦22日指出，台灣財務金融學會去年底以學會名義向國科會申請「全國性學術團體辦理學術推廣業務計畫」並獲准，執行期間為2013年1月1日至12月31日，核定金額為新台幣70萬元。由於他擔任該學會理事長，因此掛名擔任該計畫主持人。
薛琦表示，他於2010年8月起接任台灣財務金融學會理事長職務，依照該學會章程，他的任期將於今年7月底屆滿，之後他將不再掛名擔任該計畫主持人。
薛琦強調，他雖擔任該研究計畫主持人，但從未參與計畫執行工作，也未領取任何主持費或研究費。