前行政院長謝長廷21日指出，菲律賓公務船射殺我漁民事件，「我們至少要幫家屬討回公道，但對國家來說，最重要的是爭取管轄權」。
謝長廷在廣播節目表示，馬英九總統常說「兩岸互不否認治權，互不承認主權」，若按照馬英九的理論，那應該要去爭取，中華民國政府運作跟治權到底有沒有被否認？
他說，菲律賓是根據「一中政策」，所以若照馬英九的說法，菲律賓與中華人民共和國建交，菲律賓應該也不會否認台灣的治權才對，所以馬英九必須努力去證明。
謝長廷表示，一開始菲律賓拒絕台灣派調查團前去調查，到現在才要互派調查團，其實這樣的形式，在7年前民進黨執政時就有做到。
謝長廷指出，這次事件發生時，菲律賓指稱我國漁船越界，但今天漁業署定位航跡圖顯示，我方漁船並未超越界線，希望政府無論如何都能用更強硬的立場，展現實力，來爭取對方的承認。他說，不然主權、治權都不被承認的政府，就只能算是民間團體。
另外，謝長廷認為，所謂的「治權」，有的人說是管轄權，但他認為應該是指「事實的主權」，他認為馬英九互不否認治權的說法，太過虛無，應該說互相承認治權才具體，因為沒否認並不代表接受，代表有很大空間來閃避問題。