菲律賓台灣工商總會發表「以國家整體利益為上，兼顧在菲華人台商生命安全」的聲明指出，菲國執法人員開槍掃射無武裝船隻，是國際不容的犯罪行為，商會全力支持中華民國政府討公道，菲國海岸防衛隊個人不當行為應予譴責法辦。
但商會也指出，菲律賓海岸防衛隊曾多次救助台籍漁船，像是2011年2月28日發生氣爆的和忠號、2011年3月22日聖福財2號船長在菲國東北部外海重病，都是菲國海防隊馳援。
聲明指出，台商在菲律賓所發生的商業糾紛或意外事故，都必須由菲律賓相關單位的協助處理。
商會建議，回歸原點追究槍殺事件、保護在台菲人及在菲華人台商、支持長期護漁決心、就道歉釐清雙方認知、區分政府立場與正義，以及重新建立雙方溝通管道。
聲明呼籲，政府為漁民伸張正義及維護國家尊嚴時，也要兼顧旅菲台商及華人的生命財產安全，更盼台灣同胞冷靜，使政府有充裕的時間和空間妥善處理台菲漁事爭議，以維護全體台灣人民權益。