媒體報導，內政部和漁業署正在研修政府護漁標準程序，在中華民國和菲律賓重疊經濟海域部分，將研擬廢止北緯20度護漁南界，以利未來與菲國談判取得平等基礎。
對此，內政部地政司副司長王靚琇20日受訪時表示，在護漁標準作業程序中，內政部負責訂定暫定執法線，但並未劃定護漁南界，護漁界限劃定是漁業署的權責，由漁業署決定如何調整。她說：『(原音)如果以內政部很重要的角色，是去訂定暫定執法線，可是我們南界線這邊，原來我們就沒有訂出這條線，是由農委會漁業署去訂定護漁界線，現在他要把這個界線怎樣調整，還是回到漁業署的權限。就是從頭到尾這條線就是他訂的，他要怎麼訂，都是他的事。』
王靚琇強調，漁業署自行修正護漁南界並報行政院備查即可，行政院會參考內政部的意見，必要時可以一起檢討討論，但目前兩單位並未談到這個議題。
內政部地政司簡任技正王成機進一步說明，由於台日釣魚台漁業糾紛，行政院於2003年指示內政部劃設暫定執法線，劃定範圍為釣魚台海域與東部海域，海巡署再據此執行護漁工作。之後，漁業署認為台菲間海域相當重要，才在護漁標準作業程序中加入護漁南界，因此，護漁南界修正與否由漁業署決定。