台灣土地為全球的萬分之2.5，但是物種數量達2.5%，海洋物種數達全球的1/10，是一座美麗的生態島嶼，在經費、人力窘迫情形下，林務局擬透過「保護區治理」的概念，引進社區、民間團體和企業，共同來執行保育工作，找回地方專屬的生態亮點與驕傲。
林務局現正規劃，進一步建置「中央山脈保育軸」，置重點於南北長達300公里、14個保護區、面積63萬公頃，占全島面積17.5%的中央山脈保育軸。
林務局希望透過這樣的規劃，整合性保護區系統的積極管理，以有效減緩動植物棲地破碎化的負面衝擊，並且強化完整自然棲地的保育功能。
因為台灣許多保護區，集中在山林地區，但是在「淺山區」，已經形成高度開發的地區，卻是許多生物物種重要的棲息地，人類開發，壓縮動植物生存空間，甚至有瀕臨絕種的保育類動物石虎，遭到撞死等事件一再傳出。
林務局保育組表示，在「淺山區」的保育工作，目前很難透過立法，去限制已經大面積的開發使用，甚至是劃出所謂的保育區，同時全台南北縱貫，也難有這樣的預算去妥適維護，未來將依照國際趨勢，推動保護區治理工作。
而這樣原住民及當地社群的保育區，必須符合三項條件，首先是不論土地或資源的所有權，主要由社群、社區來決定，其次為社群、社區有其規劃或管理制度，第三項條件就是社群、社區管理實現保育目標。
中央山脈保育軸則是希望能透過保護區系統的積極管理，甚至是社區和社群的生態營造與保育，有效減緩動植物棲地破碎的衝擊，同時透過自然旅遊、生態旅遊，達到雙向的付出與回饋，平衡自然保育與永續利用觀念，提供生態教育的典範及活教材。
當然，不只中央山脈保育軸，全台有許多擁有獨特物種、地景資源的地區，例如早期常常看到的水雉、台北赤蛙、小水蛇等，透過地方力量支持的保護區治理，都能逐步找回當地專屬的獨特生態景觀。