這次借世衛大會場合舉行的兩岸衛生高層會議，將是2010年兩岸簽署醫藥衛生協議之後，兩岸衛生部長級的首次會晤。
邱文達下午表示，駐日內瓦人員已聯繫中國大陸方面，正在安排會晤，因為大陸有H7N9疫情，台灣有唯一的境外移入病例，雙方會在世衛大會「見面聊一下」，也會就食品安全、緊急醫療人道運送、中藥材輸出檢驗等兩岸醫藥協議內容，交換工作進度。
邱文達大會全會發言內容，預計包括台灣根除小兒麻痺、B型肝炎防治成效、二代健保財務改革，也呼應世衛非傳染性疾病防治架構，報告台灣的黃金10年願景計畫11大目標，期能2025年前將早發性非傳染病死亡率降低25%。
今年第66屆世衛大會5月20日至28日在瑞士日內瓦召開，邱文達將率20人代表團與會，參加大會全會和19場工作會議，並與美國衛生部長賽白琳等26國衛生部長舉行雙邊會議，會晤對象以非邦交國占多數。
邱文達預計在日內瓦停留3天，隨後轉往丹麥哥本哈根，觀摩並交流丹麥的長期照護模式，舉行台灣丹麥圓桌會議。