外交部今（17）日表示，我方請馬尼拉經濟文化辦事處理事主席裴瑞茲（Amadeo R. Perez, Jr.）回國，主要是向菲國政府表達我方嚴正要求，儘管菲方部分動做我方予以肯定，但菲方稱此事件為「非蓄意（unintended）」的行為，讓我方完全無法接受，希望菲國能負起國家責任。
外交部下午發布新聞稿，強調讓裴瑞茲主席與白熙禮（Antonio I. Basilio）代表返回菲律賓，除了是執行制裁手段外，也藉此要求他們回國表達我方立場。
外交部表示，裴瑞茲來台傳達菲國總統及人民對罹難家屬及台灣民眾的深切遺憾與道歉，此點我方透過行政院長江宜樺15日的記者會，已表達肯定之意，但當中讓我方無法接受的，是菲方稱此乃「非蓄意（unintended）」行為。
另外菲律賓總統府發布的授權及裴瑞茲理事主席的信函內容，都未正面、具體、充分回應我方要求。
外交部認為，在此事件中，菲國公務船侵入我專屬經濟海域攻擊無武裝的漁船，已違法使用武力，違反1982年聯合國海洋法公約第73條第1項的規定。
我國漁船遭攻擊失去動力後，菲船未依國際法救難規定上前查看及救援，就自行駛離，導致我國漁民中槍傷重死亡，此舉已明顯悖離國際人道精神。菲國公務船非法使用武力，是代表國家行為，因此菲律賓政府必需負上國家責任。
外交部還指出，在查明兇手為菲律賓公務船後，菲律賓當局卻不停推諉，還發表背離事實真相的訊息。
事實上，菲國執法船舶全長30公尺，總重115.45噸，我漁船長僅14.7公尺，寬3.68公尺，總噸位為15.15噸，屬小型漁船，且毫無武裝，顯見菲國「自衛」的說法完全不能成立。加上我漁船體彈痕累累，船身彈孔超過50個，這代表菲公務船已嚴重違法使用武力。
外交部表示，中華民國政府呼籲菲國拿出誠意，需正式道歉、賠償損失、儘速徹查事實嚴懲兇手，並儘速啟動台菲漁業談判。中華民國身為國際社會負責任且愛好和平的一分子，會依據聯合國憲章第二條以和平方式解決國際爭端。