台漁船遭菲襲擊案，我方所提的4項要求，最終僅「迅速展開台菲漁業會談」一項，獲得菲國的具體回應。但有外交官員私下評估，這項要求表面看似我方得利，實際上見仁見智，未來若真的簽署協議，我方漁民的作業可能受到更大的衝擊。
台菲過去經歷5次漁業會談，但最後皆無疾而終。
從現實層面來看，我方漁船設備精良、捕獲量較高，航程也比較遠，菲方漁船則相對落後，雙方在有爭議的海域上競爭，菲國完全無法與我抗衡，但「未來若劃清界線、訂好遊戲規則，我方未必得利」。
目前我方雖以北緯20度暫訂執法線以北海域，做為南海護漁界限，但受洋流及我國漁船近年作業影響，漁群數量已大不如前，不少漁民為了有更好的捕獲量，冒險越界進入有爭議海域、也就是執法線以南地區進行撈捕。這也是台菲漁船常發生爭議的原因。
外交官員認為，未來雙方若真的劃定界線，我國漁船一旦越界，在還未遭菲船驅趕之前，就會先面臨我國漁業署的開罰，屆時勢必將影響漁民作業模式。
外交官員坦言，依照國際區域性協定，只要漁船超過20噸，就必需裝置監控系統，我國漁船多半在15噸左右，雖不會強制要求，但不少漁船都儘量不去安裝，就算有裝置監控系統的船隻，也常常將系統關閉，避免讓政府單位清楚行蹤。
外交官員認為，台菲狀況不比台日，若比照辦理，我方漁民一些優勢可能消失，但他也坦言，在爭議海域簽署協議，這還是我方必需努力方向，制度化還是國與國解決爭議的正常運作方式。