衛生署昨晚也宣布，配合對菲制裁政策，下週署長赴日內瓦參加世界衛生大會，原訂與菲國衛生部長進行一場雙邊會議已取消。此外，衛署各局處與菲國相關交流活動，例如健保制度、藥物審核認證、緊急醫療經驗交流，都立即停止。
持美加日歐簽證菲國人
取消上網申請免簽入境
移民署昨也宣布，即起持有美、加、日、英、紐、澳及歐盟申根等國簽證（包括永久居留證）的菲律賓國民，將取消上網申請免簽入境的資格。移民署長謝立功說，移民署將全力配合政府抵制措施，但呼籲民眾理性對待在台菲勞，避免發生暴力或非理性的行為。
國科會指出，菲國受害大於台灣，估計因我方制裁損失至少台幣五百多萬元。國科會副主委牟中原指出，目前喊停的項目，包括台菲雙方每兩年召開一次的科技合作聯合會議，及天然災害與登革熱的研究等台菲專題計畫。
農委會國際處副處長蕭柊瓊說，我與菲國在二○○五年簽署「台菲農漁業合作瞭解備忘錄」，在此架構下，進行人員與技術交流，包含畜禽育種及飼養技術合作、豬瘟診斷技術訓練、玉米栽培推廣、柑橘黃龍病防治及農藥殘毒快速檢驗等，即日起終止；同時將拒絕菲方來台訪問及合作，並要求農漁業相關團體中止與菲方往來。
此外，配合勞委會中止引進菲律賓籍勞工措施，農委會也宣布中止招募菲籍漁工，以及在國外招募菲籍漁工上船作業，直到菲律賓對我方要求有善意回應後再檢討。