針對菲律賓公務船射殺我國漁民，我方擬對菲祭出經貿制裁、限制旅遊及菲勞等措施。根據財政部統計，台灣去年出口至菲律賓約八十八．八億美元，較前年成長率高達廿七．五％，居我國對其他國家出口成長率之冠；至於進口部分，我國去年自菲進口廿一億美元。由於我方貿易順差約六十七億美元，經濟部長張家祝因此認為，暫停經貿往來的制裁效果不大。
至於目前在台菲勞約佔台灣總體外勞十九％，人數約八萬七千人，其中，以產業類外勞為主，超過六萬人，其次是二萬多人的家事類看護工及家庭幫傭。
關於台菲旅遊往來狀況，交通部統計，台灣去年赴菲律賓觀光人數為二十一萬一千三百八十五人次，菲國來台旅客人數則僅十萬五千一百三十人次，且多數是來台工作的菲勞，觀光目的者僅占二成。
中華民國旅行商業同業公會全聯會秘書長許高慶分析，台灣去年赴菲的廿一萬人中，八成為觀光目的，以每人兩萬元的團費估算，估算商機逾卅三億元；相對菲律賓來台旅遊費用每人約兩萬五千元，但每年才兩萬三千人，觀光產值僅約五億七千多萬元。
全聯會理事長姚大光指出，只要政府有動作，旅遊業一定會配合，與菲律賓宿霧、長灘島等海島行程類似的商品很多，對業者影響不大。但他強調，政府若要禁止赴菲旅遊，應該要明確發佈旅遊警示燈號，讓業者可以依相關規定，為消費者辦理退費。