台菲兩國因「廣大興28號」事件陷入緊張，我國要求菲律賓「正式道歉」，否則將召回中華民國駐菲律賓「大使」；並要求菲律賓駐台「代表」返回菲國協助妥善處理本案。對此，許多民眾不解，兩國並非邦交國，為何我方稱駐菲代表為大使。
我國稱駐外代表為大使，是因為外交部為解決派駐邦交國使領館及無邦交國代表處、辦事處人員職稱複雜且不一致之問題，並配合組織改造進程，於訂定「駐外機構組織通則」時提出簡併職稱之構想，期盼未來不需特別區分派駐地點，均使用大使、公使、參事、一二三等秘書等正式外交官銜，以辦理駐外人員之任免遷調、銓敘等人事作業。
外交部說明，駐外大使或代表在外都代表中華民國，不論是稱為「大使」或「代表」，對內都是我國派在當地之「大使」，代表我國行使職權。實務上，駐外人員派駐非邦交國時，外交部仍將考量各國實際情形，因地制宜核定適當名義對外，例如派駐無邦交國之「大使」，仍以「代表」名義對外洽公或與駐在國接觸。對駐在國來說，我派駐當地之代表官員仍以「代表」之職稱對外聯繫，不致引起駐在國質疑，也不會影響對外工作之運行。
我國駐菲律賓代表處名稱為「駐菲律賓經濟文化辦事處」，代表為王樂生。菲國在台機構為「馬尼拉經濟文化辦事處」，首長為白熙禮。