2008年5月12日，中國大陸四川省汶川縣發生芮氏規模8地震，造成逾6萬人死傷慘劇。臥龍基地中，32套大貓熊圈舍中臨山面的14套被山崩淹沒，嚴重被毀。
新華網當時指出，臥龍保護區中，1隻圈養大貓熊死亡、1隻重傷、1隻輕傷。
研究中心當年6月將60多隻大貓熊送至北京、福州以及碧峰峽基地等地緊急安置。
綜合大陸媒體報導，儘管新的保護中心2012年落成，但全部的大貓熊「回家」時間依然未知。
臥龍自然保護區管理局副局長李德生透露，由於臥龍到映秀的省道303線經常出狀況，如將全部貓熊都轉到臥龍新基地，一旦發生地震等災害，很容易與外界交通中斷，影響貓熊日常補給。
雖然遭遇多種困難，李德生說，5年來，研究中心人工飼養的新出生大貓熊共45隻。目前中心共有170多隻大貓熊，其中90%都是人工繁殖。
他介紹，2008年地震後，大貓熊野化放養工作中斷了2年，但並沒有停止。震後共修建了13個貓熊野化訓練圈，最小的有4、5000平方公尺，最大達1平方公里。
李德生表示，大貓熊壽命最長的達37.4歲，平均年齡25歲。目前基地對老年大貓熊進行一系列康復、療養，以及傳染病防治工作，盡最大可能延長大貓熊的壽命。