外交部發言人高安對此強調，此事件責任歸屬有待調查，我政府要求菲律賓道歉、緝凶、賠償的立場不變，雖然這三件事無法立即完成，但「該做的絕對會做」。
駐台代表向家屬致歉意
菲律賓面對公務船槍殺台灣漁民事件軟硬兼施，駐台代表白熙禮昨天一早赴外交部與外交部次長石定會面，強調菲律賓珍視台菲友誼，不樂見此事件傷害雙邊關係，並公開向洪石成家屬致上「最深切的哀悼與歉意」；他也向石定表示，歡迎雙方司法單位共同調查，若菲方人員違反國際法和相關法律，菲國願依法起訴並且道歉賠償。
菲國海巡署長Isorena致函我駐菲律賓代表王樂生，保證會勿枉勿縱、進行「透明化」調查，並對罹難者家屬表示哀悼及歉意，已羈押肇事船上所有人員並勒令停止服勤，接受調查。馬尼拉駐台辦事處也在昨天下午發出正式聲明，再度對洪石成家屬道歉。
值得注意的是，菲國相關「道歉」都只限於對洪石成家屬，對於事件本身並未承認錯誤或道歉。
菲方指台船挑釁才開槍
菲國海巡署發言人巴里羅表示，是台灣漁船衝撞在先，菲方才射擊機械設備，如果有人因此喪生，菲方僅表達同情，而非致歉；菲國總統府馬拉坎南宮副發言人華爾地稍晚更強硬表示，這事件是台灣漁船「挑釁」，該國海巡署曾對空鳴槍示警，但台灣漁船拒絕停船，海巡署採取了「必要的行動」；菲國政府將透過海巡署調查這起事件，等調查結果出爐，再決定是否道歉。我駐菲代表王樂生已向對方表示，對於菲方目前認知「完全不能接受」。