對釣魚台主權，核心人士指出，台灣代表在這次委員會會議一開始時即重申釣魚台主權主張，日方代表隨後也回應，表達日方主張。相關人士說，台日漁業委員會屬於雙邊官方正式管道，相關記錄未來若有需要都可作為國際法庭佐證，因此台灣代表對主權主張宣示絕不會遺漏。
台日漁業協議將於10日實施。涉外人士指出，台日漁民交流頻繁，雙方漁民代表都有共識要儘快召開漁民會議。漁民對於現場執行作業看法不同，應先行協商與溝通，訂出遊戲規則，避免紛爭，對彼此都有好處。
這名人士解釋，漁業委員會與民間交流分軌，民間快的話馬上就能展開，委員會則是雙方對話機制與平台，民間召開會議可提到漁業委員會報告、彙整，再由委員做決定。
台日漁業協議常設台日漁業委員會7日首次會議在台北召開。相關人士指出，日方在漁業委員會上表達想「按部就班」，協議實施後，由於台灣漁船數量在協議適用海域是沖繩漁船的10倍之多，因此日方希望先就雙方實際上捕魚秩序深入交換意見。
台灣漁民代表則提出緩衝水域議題，擔心未來延繩釣作業若超過協議範圍，恐遭日方逮捕。
核心人士表示，漁業委員會最後達成避免雙方漁民發生衝突的共識，他認為除非違法作業，日方應不會過於嚴格取締，但相關實務狀況還是要等協議實施後才明瞭；未來若發生衝突，會在委員會內溝通。
據了解，對於緩衝水域、協議之外的北緯27度以北及八重山、宮古群島以南海域、釣魚台12浬內海洋資源共享等議題這次並未深究，雙方會在下次委員會繼續協商。