集水區內野生族群 全球最穩定
食蛇龜棲地與人類生活、農業區範圍高度重疊，加上野生龜類有高經濟價值，根據統計，九十五年至去年間，走私且經查獲的食蛇龜數量多達三千六百多隻，未查獲的更不知數量。翡管局表示，水庫集水區經廿多年的嚴格管制，累計捕捉達四百多隻不同個體，族群相當穩定。
翡管局每月與森林保育警察進行清山，但只能對水庫周邊查勘是否有陷阱或捕獸夾，近兩年查獲五起疑似食蛇龜盜獵案，僅能依水利法沒收陷阱籠，及食蛇龜活體一隻。
翡管局日前向林務局建議在集水區內劃設保護區，翡管局長劉銘龍說，如此才能保護台灣食蛇龜，以免像中國及東南亞國家一般，野生族群幾乎滅絕。
除了瀕絕的食蛇龜，翡翠水庫集水區內還有許多珍貴物種，如長鬃山羊、山羌、穿山甲、柴棺龜、麝香貓及翡翠樹蛙等，生態多樣性豐富。