計程收費上路後，前十大差額最高的路段出現最貴路段「付得多」、最省路段「省得少」的特殊現象。高公局業務組組長彭煥儒表示，國道收費站建置距離不一。最短為國道一號汐止到泰山收費站，及國道三號樹林到龍潭收費站，相隔僅廿六公里；最長間距，為國道三號大甲到名間收費站，相距長達七十六公里，收費站長短間距，相差近三倍。
「大甲到名間原本免收費路段較長，計程後因扣除免費里程，每公里都要付費，才會造成差額變大。」彭煥儒指出，計程收費排除收費站後，就沒有間距不公導致付費多寡的問題。計程後最貴的十大路段，代表的是過去長期以來付費間距較長、相對少付的族群，收費最省則表示過去付費間距較短、相對多付者。
交通部長葉匡時指出，以目前的態勢來看，免費里程廿公里的方案三，成為最終方案的機會較高。橫向國道暫定兩年內不收費，交通部預計利用兩年時間蒐集民眾使用行為，兩年後計程費率如何調整，「還有很多可能性。」目前傾向兩年後著手評估，將尖離峰時段、壅塞路段等差別費率納入考量。