台灣港務公司說，台北港的首條兩岸客輪航線由客貨兩用快速輪「麗娜號」航行台北港與平潭間，可載旅客約800人，每週5天各1班往返，單程航行時間2小時45分。
因兩岸空運直航班次增加有限，除了小三通外，近幾年兩岸也推動海運客輪航線。
台灣港務公司說，現在已有中國大陸的「中遠之星」每週航行廈門與台中港及廈門與基隆港，每週各1個往返，可載旅客約680多人。
因「中遠之星」不是快速輪，航行時間約13個小時，船上提供各種不同等級的艙房。
另外，同樣是中國大陸的「海峽號」，噸位數比「麗娜號」略小，主要經營平潭至台中港，航行時間約3小時，也是每週5天各1個往返。
台灣港務公司說，搭兩岸客輪的旅客多半是大陸團客，現在平均載客率不算高，還不到50%，但未來有發展空間。