台灣出現首例H7N9確診病例，相關單位繃緊神經，衛生署長邱文達第一時間宣布將立即啟動7大措施因應。包括針對確診病例個案所有接觸者進行追蹤調查；開放H7N9禽流感特別門診、啟動應變醫院隔離病房、增加6家合約醫院加入檢驗、加速疫苗研發、擴大宣導衛教工作，同時加強跨部會防疫措施。
原本預計6月17日起才會全面禁止傳統市場宰殺活禽的決議，現在也因為台灣第一個H7N9病例的出現，決定提前，相關配套措施近期內就會宣布。農委會防檢局副局長黃國青說：『(原音)境外移入的這個例子已經在台灣出現了，所以我想我們所有的配套措施不能等到6月17日，我們會儘早提早完成，也會盡速提早進入禁宰活禽的日期，提早的時間點，我們可能這禮拜或下禮拜我們把所有配套措施提早完成。』
對於有發燒、咳嗽症狀且7日內曾至中國大陸H7N9流感病例發生地區(上海市、江蘇省、浙江省、安徽省、北京市、河南省、山東省)旅遊者，指揮中心也將持續加強檢疫，並提醒醫師，若遇此類病患，應依法於24小時內通報，同時給予適當治療。