環保團體指責工程破壞溼地，但屏東縣政府水利處與五溝水當地居民，卻有不同聲音，水利處表示沒有施工不當，砍除一些樹木竹子，工程所需也是不得已，一些五溝水居民則是淹水淹怕了，對環保團體阻擋排水工程相當反彈。
屏東縣政府水利處長 謝勝信：「你說包商便宜行事，應該不是這樣，那裡根本沒有路可走。」
針對環團指責竹子遭受破壞，屏東縣政府水利處長，謝勝信表示，竹子因為位於行水區屬整治範圍，所做的行為皆以整治為目的。
屏東縣政府水利處長 謝勝信：「要來施工需測量範圍，要測量範圍，一定有些樹會阻擋，所以會清一些樹，從這裡別下去那一段(溼地區)，沒路可以過，所以怪手才會從這邊過，順便把會阻擋視線的竹子挖掉，那段我認為沒挖掉會擋水。」
五溝村民表示，環團所謂的溼地，大部分是有產權的私人地，河床上有淤積的高灘地，不清除的話一旦汛期來，又會威脅生命財產的安全。
五溝村民：「土地在大水來就會崩壞，我就無法耕作，每年都這樣。」
五溝村民 林太太：「他們不要啊，那些年輕人說要做溼地，這樣才有青蛙、蛇可以抓，就這樣不整治，去年就這樣水一沖，墳墓就崩壞了。」
五溝村民 劉先生：「五溝水的水草，我們幾百年都保護著，大水過就會生長的，我們也很注重水草一定的道理，不過人的生命財產更重要，要打通來。」
居民表示，對於環保團體已經不再容忍，當恢復施工時，將發動村民維護施工狀況，不想讓環保團體有機會干涉。