依據疾病管制局疫情最新資料，中國大陸自2013年3月31日起陸續公佈人類感染H7N9流感病毒病例快速增加，大部分臨床病例徵狀表現多為早期出現發燒、咳嗽等呼吸道感染徵狀，而後發展為重肺炎和呼吸困難等病徵。因此為避免受H7N9流感波及，除多運動提升自我免疫力外，更不可靠近、接觸及餵食鳥禽。
全大運主任委員趙涵捷表示，為確保H7N9疫情防治滴水不漏，除了徹底執行宣導作業， 讓所有來自全國各地的參賽隊職員及民眾有憂患意識，全大運執委會更針對各封閉場館每天落實競賽場地以漂白水消毒，同時配置乾洗手液，量測體溫，同時於總領隊會議中宣達防疫措施。
趙涵捷指出，在賽會期間將會動啟動應變小組執行各項防疫工作，務必做到防疫滴水不漏，將疫情阻絕於外，同時也希望各校隊職員全力配合防疫作業， 讓102全大運在緊張刺激的比賽氣氛中圓滿落幕。