根據台北榮總所做的「陳前總統出院建議報告」，認為陳水扁出院後的環境、家屬支持及選擇適當處所療養，將有助於改善病情並降低復發風險，因此建議可居家療養，或者是安置在設有精神科的綜合醫院或精神專科醫院。
針對北榮的建議，法務部政次陳明堂19日表示，目前法律沒有將受刑人住處當成執行徒刑場所的依據，所謂「居家療養」於法不合，不可採行。陳明堂說：『(原音)居家治療在現行法上是沒有，我們不能，否則監獄會變成違法失職。』
至於保外就醫部分，陳明堂指出，陳水扁罹患嚴重憂鬱症，但病況可以藉由戒護醫療方式處理，加上考量刑罰公平性，認為陳水扁不符合保外醫治的條件。陳明堂說：『(原音)到目前為止，沒有因為精神疾病而獲得保外醫治的前例，因此基於刑罰公平性，尚難以憂鬱症做為保外醫治理由，否則對其他患病的受刑人可能會造成歧視待遇。』
法務部強調，台中監獄附設培德醫院具有高度醫療專業及醫事經驗，符合陳水扁的就醫需求，並已延請台中榮總提供醫療協助，由該院派員擔任醫療小組召集人，輔以中國醫藥大學醫師組成醫療小組，應能給予陳水扁完善且妥適的醫療照護。