至於高鐵列車設定引爆時間則非原先外傳的十時，而是即將進入新竹站的九時廿五分，幸未引爆。
警調原本推論，胡宗賢、朱亞東在立委服務處放下行李炸彈後，隨即趕往機場並以預購的機票登機潛逃出境，但清查後卻發現，胡宗賢、朱亞東雖同時購票，卻是各付各的。
檢警調查，胡宗賢雖是炸彈案的策畫者，卻以刷卡方式購買一張機票；受託放置炸彈的朱亞東，則是排在胡宗賢之後以付現方式購票；更離奇的是，由於案發當天是周休假期前夕的星期五，不少飛往大陸及港澳的班機皆已客滿，胡、朱兩人還是後補後才得以登機離境，並非原先檢警推斷的預購機票潛逃。
胡宗賢一手策畫行李炸彈案，事後卻和朱亞東各付各的帳，甚至連在珠海、中山投宿酒店也是各自拆帳，是要掩人耳目還是另有隱情，檢警也正釐清。
檢警也確認，高鐵上的行李炸彈，引爆時間並不是定在原先外界認定駛入台北站的十時，而是九時廿五分，倘若不幸引爆，列車地點則是即將進入新竹站之際，此一引爆時間、地點也讓本案更添疑雲。
檢警發現，胡宗賢在珠海酒店入住後，並未退房即使用另名女子身分轉往中山住宿，企圖切割潛逃大陸的行蹤，未料大陸公安居然能迅速識破逮人，檢警對大陸公安能耐也自嘆：「真是百思不得其解」。