台灣高鐵公司則說，高鐵列車上有疑似爆裂物時是否需要停車並疏散旅客，完全由高鐵警察專業判斷。十二日選定疏散旅客的車站為桃園站而非新竹站，即是高鐵警察的決定。
林滄敏表示，前天上午從台中搭高鐵赴立法院參加核四公投表決，沒想到趕上這班驚魂列車。高鐵在桃園站安排轉搭另班列車，無法按時到立院，影響國家政策法案決定。但不止是他，這次事件也讓車上六百多名乘客都延誤時間、犧牲權益，並造成全民驚慌。
「這次事件，高鐵緊急應變和危機處理都嫌不足！」林滄敏說，他從台中站一上車沒多久，大約九點十幾分，就聽到車上廣播「有旅客行李放在第十一車廂洗手間，請取走！」乍聽不以為意，但之後又廣播兩次，覺得有點不尋常。
高鐵台中站到新竹站車程十五分鐘，新竹站到桃園車程七分鐘，林滄敏說，到了桃園列車長才要求全部乘客下車轉換到另一列車，他心裡患疑，卻也和多數人一樣，以為列車故障，事後聽說車上有爆裂物，馬上聯想起車上廣播的兩件行李。
台灣高鐵公司說，高鐵警察研判爆裂物的破壞性需一段時間。而高鐵站距不長，列車行進間進行爆裂物檢查與停車檢查，意義差不多，也可避免影響列車營運與旅客權益。在高鐵警察建議停車疏散旅客時，列車即在桃園站停靠，快速的疏運旅客。
成大政治系助理教授蒙志成昨天在臉書上貼文，寫自己搭乘高鐵就像在鬼門關前走一遭。
蒙志成說，車行到苗栗一帶開始，他「聞到極濃的汽油味」，心想電力驅動的高鐵，不應該有這種味道，「是有人帶汽油揮發物上車嗎？」他還聯想到一九九九年的「立榮航空爆炸案」。
蒙志成表示，他接著聽到列車長開始廣播「清潔人員請迅速至第十一節車廂廁所」。到了新竹站，他在廁所前看到一個警察、列車長和蹲在地上的清潔阿姨在交談。警察對著無線電說：「我待會壓車到桃園，你們那邊準備一下…東西看起來不像清潔劑，有點黏黏的…」。
他指出，車行到桃園，列車長請十一、十二車的乘客改坐到八至十車，坐定之後，列車長又廣播「各位旅客，我們在桃園站暫停」；約莫十五分鐘後，列車長再次廣播「請六一六次列車全部旅客，到第一月台南下方向換車」。
蒙志成說，因為延誤超過三十分鐘，換了一張可以五折高鐵乘車券，事後才知自己在鬼門關前走了一遭。