為積極因應H7N9流感疫情，北市府於102年4月3日即成立「臺北市政府因應H7N9流感跨局處應變小組」，由陳雄文副市長督軍，啟動市府團隊積極執行各項防疫工作，並配合中央流行疫情指揮中心會議時間，自下週起固定於每週二下午召開應變小組會議，以利配合中央防疫政策修正北市府應變策略，目前北市府重要防疫作為，包括:
(一) 加強國內外人與禽類禽流感疫情監測: 4月1日至9日北市已訪視13間養禽戶(12間採樣)、6處公園(4處採樣) 26家鳥店(10家採樣)。目前皆無發現有H7N9禽流感病毒。
(二) 加強環南家禽批發市場消毒與清潔工作:每日進行市場全場區清潔工作。
(三) 加強動物園園區消毒與監測:每天動物欄舍出入口進行消毒、每周進行鳥園消毒，以及對遊客加強禽流感防治宣導。
(四) 加強入境發燒旅客健康監測工作:追蹤結果未有發現疑似H7N9流感。
(五) 加強北市醫療院所看診四問(TOCC)、感染管制整備與稽核工作: 北市衛生局聘請感控專家，針對各醫院整備情形進行無預警稽查工作，將於4月10日前完成16家傳染病指定隔離醫院稽查工作。
(六) 加強傳染病防治應變醫院整備與病患收治能力：北市聯合醫院和平婦幼院區已啟動收治通報個案工作。
(七) 整備北市各項防疫物資：北市儲備供防疫使用之隔離衣、口罩、公費流感抗病毒藥劑皆維持在安全庫存量；另市府各局處也著手儲備(乾洗手液、漂白水、口罩等)，以供第一線工作同仁或民眾使用。
(八) 加強安養護等長照機構防治:已請本市各安養護機構、護理之家等，加強住民健康監測、機構感染管制與訪客管理等工作，近日市府主管單位將進行稽查工作。
(九) 加強校園防治宣道:已通知北市300家各級學校進行防治宣導工作。
(十) 加強大眾運輸工具消毒與防治宣導:已通知相關公(工)會加強大眾運輸消毒及人員防護，並協助對乘客進行H7N9流感防治宣導；另也於各捷運站透過廣播、跑馬燈及廣告燈箱進行宣導。
(十一) 將通知台北市各館業者加強入住旅客(尤其來自大陸地區)、工作人員之健康監測與環境消毒工作。
(十二) 衛教防治宣導:已透過市府各局處於各機關、動物園、大眾運輸及家禽市場等處宣導透過跑馬燈、單張、網站等進行「對抗H7N9流感 6不3要 預防有一套」防治宣導。
北市衛生局提醒民眾如前往中國大陸，應避免接觸禽鳥類，食用雞、鴨、鵝（含蛋類）需注意完全熟食，並落實洗手等「6不3要」禽流感防治措施。入境後做好自我健康監測7天，如有出現類流感(發燒、咳嗽…)等不適症狀，應戴口罩速就醫並主動告知醫師曾至大陸旅遊。相關資訊，可至臺北市政府衛生局網站首頁(http://www.health.gov.tw/)/禽流感防治專區或撥打防疫專線2375-3782諮詢或1999市民專線皆可查詢。