兩岸交流頻繁，中央流行疫情指揮中心持續加強對入境旅客的檢疫及監測措施，並在6日邀集23個相關部會召開第二次跨部會會議。疾病管制局副局長周志浩表示，從5日中午至6日上午9時，共有35位入境旅客有發燒症狀，其中11位來自中、港、澳地區，更有2位是來自中國大陸禽流感疫區的民眾。
周志浩指出，2位來自大陸疫區的民眾，一位是6歲男童，但只有發燒，沒有其他類流感等上呼吸道症狀，因此排除感染可能。另一名則是由桃園機場入境的27歲男性，有多項類流感症狀，已由相關單位後送至醫院採集檢體中，待檢驗報告出爐後，疾管局將再對外說明結果。他說：『(原音)另外一位是27歲的男性，他入境的時候，我們發現他有發燒、倦怠、腹瀉、頭痛、咳嗽等症狀，符合我們後送的條件，已經由我們的同仁陪同他到醫院進行採檢，目前他的檢體是在等待檢驗當中。』
農委會動物防疫組組長邱垂章表示，由於中國大陸是禽流感疫區，因此目前大陸的活禽及禽肉產品禁止輸入台灣，農委會將加強邊境管制及監測病毒。至於境內防疫方面，農委會針對雞、豬、鵝、鴨、寵物鳥及野鳥等，也持續採取例行檢測，目前尚未檢測出病毒。
此外，交通部也已啟動緊急應變計畫跟機制，增加航廈消毒、航班檢疫、口罩販售等因應作為，並請接待國外旅客的旅行社及導遊密切觀察旅客狀況，即時通報觀光局及各機場旅遊服務中心。