農委會防檢局副局長黃國青表示，民國九十八年擔心候鳥與鴿子混在一起傳染禽流感，早已將鴿子列為監測對象。監測範圍包含中正紀念堂、華中橋的群聚野鴿，還有各防治所、民間飼養、鳥街販售的鴿子及寵物鳥，一至三月偵測兩百多件雖無異常，呼籲疫情期間國內賽鴿活動暫時喊卡。
全國賽鴿協會「台灣海翔國際聯盟」回應，國內鴿舍講究環保、清潔，大部分從比利時、荷蘭、德國進口種鴿繁衍，不會到對岸比賽；上周南部賽鴿活動剛結束，北部競賽即將展開，若真的危害到國人安全將配合政府停辦賽事。
賴秀穗指出，各式接種實驗都顯示鴿子並非禽流感宿主，鴿子不會感染Ｈ５Ｎ１、Ｈ５Ｎ２等禽流感，「鴿子百分之百不是源頭」，他判斷，Ｈ７Ｎ９疫情已有三個月之久，早已散布廣泛才連鴿子都受到感染。
賴秀穗提醒，四月候鳥已北返，排除候鳥傳播疫情的路徑，目前最有可能傳播的只有出入境的旅客與走私的禽鳥類。若疫情已在對岸潛浮三個月，兩岸台商、旅客交往密集，國內養雞場疫情更應嚴密管控、消毒，不能隱匿。
前家畜衛生試驗所長劉培柏認為，Ｈ７Ｎ９感染路徑由家禽開始，鴿子、麻雀飛到家禽場偷吃飼料遭感染，由於鴿子抵抗力高，帶著病毒不發病，最後才傳染給人類，「鴿子也是受害者」，麻雀則是另一需要觀察的對象。
劉培柏表示，大陸在人類身上分離到的Ｈ７Ｎ９基因序列只有一個鹼性胺基酸，表示為低致病性禽流感，大陸應檢查家禽是否感染Ｈ７Ｎ９。