行政院農業委員會動植物防疫檢疫局表示，為加強防範中國大陸H7N9禽流感傳入，已採取各項預警強化及防疫整備措施，並與衛生署共同在邊境加強檢疫聯防。
另外也協請海岸巡防署及財政部關務署加強緝私，強化國內主動監測及疫情查報作為，積極掌握國外疫情發展狀況，並成立應變小組因應及處置可能疫情狀況。
防檢局表示，禽流感主要藉由與帶毒禽鳥接觸而傳播，國內家禽雖未曾檢出H7N9病毒，但為有效防範其媒介與發生，已請地方政府及產業團體要求業者提升養畜禽場防鳥及消毒等生物安全防範措施，防杜媒介傳播，並透過產業傳真簡訊系統廣為周知，同步配合執行。
防檢局指出，依國內監測結果顯示，台灣仍是H7N9動物疫情的非疫國，將持續監控國際疫情即時因應，並與緝私單位合作強化邊境檢疫與查緝，阻絕疫病於境外，請社會大眾勿過度恐慌。
此外，防檢局透過管道輔導養禽業者提高警覺，加強人車門禁管制及動線移動管理、防鳥設施設置維護及清潔消毒措施，防杜生物媒介傳播，遇有可疑病例，即時通報所在地動物防疫機關處理。
家禽業者方面，台灣養雞、鴨、鵝及豬協會都表示，畜場禁陸客參觀，業者兩岸往返要自主管理7到10天。