吳副總統辦公室上午發出聲明稿表示，有關李朝卿停職一事，今天有媒體報導「吳敦義日前特別親晤李朝卿，溝通撤回申請一事」、「副總統與李朝卿達成先復職再請假共識」，均屬臆測之詞，並非事實。
聲明稿指出，副總統就李朝卿復職與否，未曾與李朝卿通過電話亦未見過面，更無所謂主動「銜命」與李朝卿溝通之事。
副總統表示，他是在1日中午總統府五人小組會議，及稍後接受媒體訪問時表達個人看法，「除法律規定外，仍應考量社會觀感與國人對於廉能政府的高度期待，李朝卿實應鄭重考慮撤銷復職申請或請長假，專心打官司，以力爭其所堅稱的清白」。
聲明稿指出，至於內政部最後於1日晚間依「公務員懲戒法」將李朝卿移送監察院調查，並予以停職，副總統充分了解並尊重主管機關決定，而且這與他建議的最後結果一致。