副總統吳敦義辦公室今（2）日表示，媒體報導「吳敦義日前特別親晤李朝卿，溝通撤回申請一事」、「副總統與李朝卿達成先復職再請假共識」，均屬臆測之詞，並非事實。
吳敦義說，就李朝卿復職與否，未曾與李朝卿通過電話亦未見過面，更無所謂主動「銜命」與李朝卿溝通之事。他是在本週一中午總統府五人小組會議以及稍後接受媒體訪問時，表達個人看法「除法律規定外，仍應考量社會觀感與國人對於廉能政府的高度期待，李朝卿實應鄭重考慮撤銷復職申請或請長假，專心打官司，以力爭其所堅稱的清白」。
至於內政部最後於一日晚間依「公務員懲戒法」將李朝卿移送監察院調查，並予以停職，吳敦義說，充分了解並尊重主管機關決定，而且這與他建議的最後結果一致。
★還原現場：
吳敦義昨日下午出席「花旗聯合勸募感恩記者會」後受訪表示，「從法律上來看，他會停職是因為被羈押的因素，既然羈押解除了，那個停職的因素就消失了，所以他如果依法申請復職，依照法律的本意，跟過去內政部在處理同類案件的經驗來看，是應該會核准他復職。」
吳敦義還說，「不過如果除了考慮法律的因素，也能考量到現在國民大眾對於更嚴謹的廉能政治，尤其是對於負重要責任的政府首長，要有更好的廉潔的操守，那另外再考慮，他本身現在只是被起訴，他依法可以在一審判決之前，他可以力爭自己的清白，所以如果能夠專心去處理這個官司，維護他很堅定的那種力爭清白的目標，所以民間有些人士呼籲他，或者就撤銷原有的復職申請，或者提出請假，讓他自己能夠在現階段專心地去打官司，維護自己很堅定的這種力爭清白，我覺得對符合國家的法律，也符合社會的觀感跟期待，以及國人非常堅定的要求，更嚴格更好的廉能政治的期望，應該是比較符合的。」
昨晚，內政部長李鴻源宣布，依公務員懲戒法將李朝卿移送監察院調查，並因情節重大依法繼續予以停職。