對於網路駭客入侵，馬表示，已經有相當長的時間，這不是新的現象，「我們的電腦也曾被中國大陸入侵」，當然也會盡量做好防衛，逐步減少可能造成的傷害。
馬表示，台灣未開放大陸政策之前，駭客入侵的情形的確比較少，開放之後「因為大量旅客來台，這類風險自然增加」，所以這幾年政府開始強化保密等工作。
馬指出，雖偶有發生洩密問題，或發現為中國工作的情況，「但都在我方掌握中」。
至於是否擔心美國因北京可能竊取情資而不願出售F-16CD型戰機給台灣？馬則表示，目前已查獲部分洩密個案，「其中有一些涉及間諜的犯罪」。馬強調，截至目前為止，「情節還未如此嚴重！」我方與美方在這些領域也有充分的合作。
外媒問馬英九對中國新領導人習近平的印象如何？馬表示，習對台灣的政策，「大致上和前任差不多」。