兩岸日前正就兩會互設辦事機構議題進行溝通，有消息指出，海基會秘書長高孔廉，很可能會是駐大陸首任代表。對於這樣的傳聞，陸委會表示並不知情，海基會發言人馬紹章也表示未得知這樣的消息。
媒體報導，高孔廉與海基會董事長林中森，在兩岸事務上常出現不合讓他心生退意。若真的去職，很可能順勢接任海基會駐大陸代表。而高孔廉在受訪時也未否認，只輕描淡寫的說，「再看看」。
消息指出，灣派駐大陸代表目前規劃14職等，官階雖比海基會副董事長兼秘書長低，但在大陸能握有真正實權。依高孔廉的經歷，升任這樣的職務相當合適。
海基會發言人馬紹章受訪時，否認這樣的消息，同時對海基會兩位龍頭出現不合情況，他也說，「沒有這樣的事。」
陸委會人士指出，目前兩會辦事機構功能、組成仍在討論中，但14職等符合規劃。他透露，未來辦事機構不會只有一個，很可能最重要的辦事機構是由代表派駐，剩下的則為辦事處處長，職等也會有差距。
但對高孔廉接任駐大陸代表，該人士認為，在相關內容尚未討論前，出現這樣的聲音實在太早，就算有意爭取也不該選在此時。