王塗發指出，中油常主張很多的成本結構因涉及商業機密而無法公開，最後也都是「自己講自己算」，老百姓怎能信服？他強調，就算有新公式，但看起來還是很多「奇奇怪怪的東西」，重點在於成本「黑箱」能否透明化。
王塗發質疑，台綜院新公式中的「固定費用」、「其他費用」等，真的不能即時檢討來反映真實價格，非得每年檢討一次嗎？他也不解，若中油本身就有經營不善問題，為何一定要老百姓保證它賺錢？他舉例，像中油就說過因煉油設備老舊而得買品質較高且較貴的北非原油，但「老舊設備到底更新沒」？還是成為一再花大錢購油的理由？
他又說，像最近各界已指出，為何計算稅費（貨物稅、空污費、土污費與石油基金）後還要再收五％營業稅，形成「稅上加稅」，這些都是應該立即改革的問題，但未見公式中有所討論。