馬英九總統出發前往梵蒂岡出席新任教宗就職彌撒，卻因為媒體無法隨行採訪，引發總統府記者集體抗議，馬總統在得知事態嚴重後，要求幕僚以及外交部進行協調，直到出發前4小時才確定10名媒體記者可以隨行，讓馬總統連任後首次出訪未出發就先備受批評。
馬英九總統親率慶賀團出發前往梵蒂岡，卻因為府方以保密為由，嚴禁任何消息走漏，14日深夜逕自決定2家共4人媒體名單，引發其他媒體不滿，外交部次長史亞平15日更表示，基於行政作業考量，由總統府「值月電視台」隨行，不過由於此宣布並未予總統府記者聯誼會協調，引發記者不滿，群起抗議。
史亞平則說，整個籌備期間只有兩個工作天，為了在短時間內籌組慶賀團，所以精簡規劃，雖然有專機，但還要考量各國慶賀團在同一時間湧進羅馬，旅館一房難求，車輛安排也困難，所以基於行政作業考量，無法法邀請很多媒體隨行，所以由值月台負責，並非自由報名參加，加上媒體共享影音，隨行的電視台為所有媒體提供服務，所以由外交部提供旅費。
總統府17日上午11時則以簡訊通知「開放採訪」，不過卻要求欲採訪的記者在40分鐘內必須完成報名手續，補報名記者除需負擔機票8萬2千元、住宿1晚2萬5千元外，還無法獲得採訪證，住宿飯店也與特使團不同住。
對於引發記者抗議，府方則解釋，由於前置作業加上行程敲定只有1周左右時間；而預定公布總統行程的時間，距離出發時間不到60個小時，加上高層要求保密，才會導致過程疏漏，未來將進行檢討。