教廷樞機主教團確定選出新任教宗，馬英九伉儷也隨即拍板親自出席就職彌撒。馬英九首度訪問梵蒂岡的「慶誼專案」曝光後，總統府以事前必須嚴格保密、事後作業時間倉卒、包機和當地住宿無法安排為由，片面指定隨訪媒體，引發眾怒。
馬英九獲悉記者集體抗議後，要求發言系統緊急應變；由於羅馬及梵蒂岡當地湧入信徒、媒體，加上各國元首陸續抵達，交通和住宿安排困難，儘管我駐教廷大使王豫元為此徹夜奔走，與總統府聯繫，還是拖延至出發前四小時才確定開放十名記者隨行。
府方人士解釋，由於此行前置作業加上行程敲定只有一周左右時間；而預定公布總統行程的時間，距離出發時間不到六十個小時，加上高層要求保密，才會導致過程疏漏，府方高層已表示將深刻檢討。