法官判決指出，六十八歲林基雄，是署新北門分院二樓護理之家院民，也是唯一具有自主行動能力之人，裡面還住著數十位長期臥床，無法自理生活的病人；但林嫌長期被直腸惡性腫瘤合併膀胱轉移、慢性阻塞性肺病等病所苦，對世人心生怨懟。
去年十月廿三日凌晨三點多，他因多次拉肚子，頻頻需更換排便袋，心情不佳，走出護理之家病房，以打火機點燃衛生紙，丟進二樓婦產科護理站櫃台下，接著還到婦產科西南側堆積物品產房內，以打火機點燃上衣及被單，丟進放有衣物的易燃物品中後離開醫院，全身赤裸地躲在北門分院後方廢棄空屋。
縱火案釀成十三人死亡、五十九人受傷，他當天即被警方找到，也坦承縱火，台南地方法院裁定收押禁見。地檢署檢察官李駿逸去年底依殺人、放火燒毀建築物等罪嫌提起公訴，考慮他已是癌末病患，遂未對他求處死刑。
林基雄在檢察官調查時雖曾供稱「我只想死一死，我很後悔，我和那些人沒有冤仇」，但在法院審理時，卻當庭嗆聲「燒死就燒死，我就沒有死，收押就收押，當時失去理智」，加上他也無法和被害人家屬和解，也未表達歉意或賠償，更令被害人家屬身心鉅痛。
合議庭認為，林基雄僅因個人情緒不佳，即放火殺人，手段冷酷凶殘，泯滅人性，且毫無悔意，經再三斟酌，認為其行為已不見容於社會，求其生仍不可得，遂判死刑，褫奪公權終身。全案還可上訴。
目前在押的林基雄，身體相當虛弱，後續治療問題，均由台南看守所負責，他如有不適，會立刻戒護就醫；所內人員擔心，他不知是否能夠撐過二審的判決。
台南市立安南醫院內科主任李聰明表示，大腸直腸癌末期，如有定期接受治療，至少都還可活半年以上，意志力比較強的病患，甚至還可以活更久。