漁業署表示，為因應漁會屆次改選，已由農委會、法務部、法務部調查局及內政部警政署等單位組成漁會改選工作督導小組，輔導各直轄市、縣（市）政府督導各漁會做好相關選務工作，並於16日開設中央選務督導中心，加強選務聯繫工作，並防範重大選務突發事件，俾利漁會選務工作順利進行。
漁業署說明，為防範金錢及暴力介入 102 年漁會全面改選及總幹事遴聘事宜，最高檢察署於 102 年 2 月 6 日成立「查察賄選及暴力督導小組」，各地方法院檢察署同步成立「查察賄選及暴力執行小組」，並設「選舉查察聯繫中心」，指派人員輪流值勤，受理妨害選舉刑事案件之告訴、告發、自首等事項，以端正選風。
漁業署強調，漁會為臺灣地區重要的漁民組織，係以保障漁民權益，提高漁民知識、技能，增加漁民生產收益，改善漁民生活，促進漁業現代化，並謀其發展為宗旨的漁民團體。期望漁民展現民主素養，經由公平、公正的乾淨選舉，產生賢能人士進入漁會，服務漁民，開創漁會與漁民雙贏之未來。